Тренажёр по биохимииИнтерактивный курс
Витрина · живые модели

Интерактивные схемы и графики курса

Меняйте параметры и следите, как перестраивается фигура и её вывод. Одним переключателем подписи под всеми моделями переводятся на простой язык.

01

Строение, свойства и функции белков

43 модели
подраздел 1·I

🧬 Аминокислоты и пептиды

15 моделей

Кислотно-основные свойства: заряд, pK и pI

Выбери аминокислоту и двигай ползунок pH. Жёлтая кривая — суммарный заряд молекулы; где она пересекает ноль — там pI (изоэлектрическая точка: молекула — цвиттер-ион, суммарный заряд 0). Пунктиры — pK каждой группы.

Аминокислота
pH
7.0

При pH 7.0: суммарный заряд ≈ +0.08 — суммарно положительный → в электрофорезе движется к катоду (−).
α-COOH: −1 · имидазол (радикал): 0 · α-NH₃⁺: +1
pI = 7.59 · Имидазол с pKa≈6: при физиологическом pH наполовину заряжен — идеальный участник кислотно-основного катализа.

Электрофорез: разделение по заряду

При заданном pH аминокислоты с разным зарядом тянутся к разным электродам: отрицательные — к аноду (+), положительные — к катоду (−). При pH = pI остаются на старте. Двигай pH и смотри, как они разъезжаются.

pH
7.0

pH 7.0: на старте (заряд≈0, pH≈pI): G, H. синие (+) → к катоду, красные (−) → к аноду.

Уравнение Хендерсона–Хассельбаха

pH = pK + log([A⁻]/[HA]). При pH = pK форм поровну (50/50); разница ±1 даёт соотношение 10:1. Двигай pH и pK.

HA 9%
A⁻ 91%
pH
7.0
pK
6.0

pH − pK = 1.0 → [A⁻]/[HA] ≈ 10.0 : 1

Гистидин — pH-переключатель катализа

Имидазол гистидина имеет pK ≈ 6, поэтому около физиологического pH 7 он частично заряжен и способен и отдавать, и принимать протон — отсюда His так часто в активных центрах ферментов (кислотно-основный катализ).

заряжен +9%
нейтрален 91%
pH
7.0

pH 7.0: заряжено 9%. Преобладает нейтральная форма (акцептор H⁺).

20 аминокислот — интерактивная таблица

Кликни аминокислоту — увидишь её структуру и свойства. Фильтры сверху подсвечивают нужную группу.

Гистидин (Гис / H)

Класс: Основные (+ заряд)

pK: α-COOH 1.82 · имидазол (радикал) 6.00 · α-NH₃⁺ 9.17

pI: 7.59 · гидрофоб.: -3.2

Кодоны: CAU, CAC

Тип: эссенциальная · + заряд, ароматич.

Имидазол с pKa≈6: при физиологическом pH наполовину заряжен — идеальный участник кислотно-основного катализа.

Анатомия α-аминокислоты

Кликни по части молекулы — узнаешь, что это и зачем.

H₃N⁺COO⁻HR
Кликни по части молекулы слева. Три группы (–NH₃⁺, –COO⁻, –H) одинаковы у всех аминокислот; различается только радикал R.

Пептидная связь: конденсация ↔ гидролиз

Связь образуется конденсацией: –COOH одной и H₂N– другой аминокислоты соединяются с выделением воды. Гидролиз — обратный процесс (нужна вода).

Две свободные аминокислоты. Нажми «Конденсация» — –COOH и –NH₂ соединятся с потерей воды.

Пептидная связь — плоская и частично двойная

Из-за резонанса связь C–N имеет характер частично двойной → она плоская, вращение вокруг неё запрещено (свободны только углы φ и ψ). Транс почти всегда выгоднее цис (цис — в основном перед пролином).

Транс: соседние Cα по разные стороны связи C–N. Преобладает почти всегда — меньше столкновений.

Диаграмма Рамачандрана (φ / ψ)

Каждый остаток описывается двумя углами поворота остова: φ (вокруг N–Cα) и ψ (вокруг Cα–C). Возможны не все сочетания — двигай ползунки и смотри, в какую зону попадаешь.

φ
-63°
ψ
-43°

φ = -63°, ψ = -43° → α-спираль (правозакрученная).

Хиральность: L- и D-формы

Проекция Фишера: COO⁻ сверху, R снизу. У L-формы аминогруппа слева, у D — справа (зеркало). В белки встраивается только L. Глицин (R = H) ахирален.

L-форма: аминогруппа слева. Все белковые аминокислоты — L: активный центр фермента, как правая рука, «пожимает» только левую (CORN-правило).

Игра: разложи по классам

Кликни аминокислоту, затем — корзину её класса. Верно — останется в корзине, ошибка — корзина мигнёт.

Верно: 0 из 22 · осталось 22

Шкала гидрофобности (Кайт–Дулиттл)

Чем правее — тем гидрофобнее остаток (прячется внутрь белка); чем левее — тем гидрофильнее (торчит наружу, к воде).

Дисульфидный мостик (цистеин)

Две –SH группы цистеинов при окислении образуют ковалентную связь –S–S–, сшивающую участки белка. Восстановление её разрывает.

Две свободные –SH группы. Окисление (потеря 2H) соединяет их в S–S.

Поглощение УФ при 280 нм

Ароматические остатки Trp и Tyr поглощают свет ~280 нм. По этому поглощению измеряют концентрацию белка (главный вклад — Trp).

Trp (W)
2
Tyr (Y)
4

ε₂₈₀ ≈ 16 960 M⁻¹·см⁻¹ (Trp×5500 + Tyr×1490). Больше Trp/Tyr → сильнее сигнал; отсюда измерение концентрации белка по A₂₈₀.

Клиника и «зачем это»

Кликни тему, чтобы развернуть.

подраздел 1·II

🧩 Структура белка

5 моделей

Четыре уровня структуры белка

Белок — это не просто цепь аминокислот, а свёрнутая из неё трёхмерная форма. Нажимай 1°→4° и смотри, как уровни надстраиваются друг над другом.

1° Первичная — порядок аминокислот в цепи (бусины на нитке), скреплённых пептидными связями; задаётся геном. Из неё вытекают все остальные уровни.

α-спираль и β-складчатый слой

Два главных узора вторичной структуры. В спирали водородные связи идут вдоль цепи, в слое — между соседними тяжами. Переключай и сравнивай.

α-спираль: цепь закручена правозакрученной пружиной (≈3,6 остатка на виток). Водородные связи идут вдоль цепи (C=O ↔ N–H через 4 остатка). Радикалы торчат наружу; пролин ломает спираль.

Денатурация: что разрушает форму белка

Двигай ползунок «стресса» (нагрев, денатурант): нативный белок разворачивается, теряет функцию и слипается в осадок. Пептидные связи при этом целы — рвутся только слабые.

Стресс (жар / денатурант)
0

Белок в нативной форме: компактный, упорядоченный, работает. Стресс низкий (0%).

Силы, удерживающие третичную структуру

Что скручивает цепь в компактный клубок. Нажимай кнопки — подсветится каждая сила и её роль.

Гидрофобное ядро (главная сила): неполярные радикалы прячутся от воды внутрь. Точнее, вода выталкивает «жирные» куски внутрь — основной двигатель сворачивания.

Глобулярные и фибриллярные белки

Две формы белков: компактный растворимый «клубок» и вытянутая нерастворимая «нить». Переключай и сравнивай свойства.

Глобулярный белок: свёрнут в компактный «клубок», растворим в воде (гидрофобное ядро внутри). Это ферменты, гемоглобин, антитела — «динамичные» функции.

подраздел 1·III

🧬 Сворачивание и контроль качества

4 модели

Воронка сворачивания (энергетический ландшафт)

Белок не перебирает все формы подряд (это заняло бы вечность — парадокс Левинталя). Он скатывается «по воронке» к самой устойчивой форме. Двигай ползунок — следи за спуском.

Прогресс сворачивания
0

Развёрнутый белок: множество возможных форм, высокая энергия (верх воронки).

Шаперонин: сворачивание в «камере» (HSP60)

Некоторые белки сворачиваются в изоляции: заходят в «бочку»-шаперонин, крышка закрывается, и белок складывается без помех от соседей (за счёт АТФ). Жми «Дальше».

Неправильно/не до конца свёрнутый белок с липкими участками — рискует слипнуться с соседями.

Контроль качества: судьба белка

Что происходит с белком после сборки. Выбери сценарий — увидишь путь.

Белок свернулся правильно → идёт работать. Няньки помогли.

Викторина: сворачивание и контроль качества

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Что доказал опыт Анфинсена?

Счёт: 0 / 0
подраздел 1·IV

🧬 Функционирование белков

4 модели

Кривая насыщения и Kd (сродство)

Прочность связывания = сродство, его мера — Kd (концентрация для 50% занятости). Выбери лиганд и двигай концентрацию: кривая выходит на плато (насыщение), зелёная линия — Kd.

Лиганд
Концентрация
20

Лиганд: Кислород (Kd 26). При концентрации 20 занято 43% центров. Kd = 26 — концентрация для 50% занятости; чем меньше Kd, тем выше сродство.

Индуцированное соответствие (рука-перчатка)

Карман не жёсткий: при связывании он подстраивается и «обнимает» лиганд, заодно нацеливая рабочие группы. Нажми, чтобы связать/отпустить лиганд.

Свободный белок: карман примерно готов («ключ-замок»), но окончательно подстроится при связывании («рука-перчатка»).

Молекулярный мотор: шаговый цикл

Мотор превращает энергию АТФ в шаги: связал АТФ → рабочий ход → отсоединился → встал впереди. Жми «Дальше» и следи за шагами.

Мотор прочно стоит на «рельсе» (обе «ноги» держатся). Ждёт топливо-АТФ.

Викторина: функционирование белков

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Что такое Kd (константа диссоциации)?

Счёт: 0 / 0
подраздел 1·V

🩸 Гемоглобин: перенос кислорода

4 модели

Кривая насыщения Hb / Mb и её сдвиги

Гемоглобин — S-образная (кооперативная) кривая, миоглобин — гиперболическая. Двигай pH, 2,3-БФГ, CO₂ и температуру — смотри, как сдвигается P₅₀ и сколько O₂ отдаётся тканям.

pH
7.40
2,3-БФГ
1.0
CO₂
40
37.0

P₅₀(Hb) ≈ 26 мм рт.ст. Норма (~26). Между лёгкими и тканью Hb отдаёт ≈ 21% запаса. Миоглобин (P₅₀≈2) — депо O₂ в мышце.

T ⇄ R: кооперативное связывание

Четыре субъединицы держат по одному O₂. Первый связанный кислород «расслабляет» комплекс из T- в R-форму — остальные садятся легче. Двигай pO₂.

pO₂, мм рт.ст.
26

pO₂ = 26 мм рт.ст. → насыщение ≈ 50%, занято 2 из 4 гемов. Гемоглобин в R-форме: первые связанные O₂ «расслабили» комплекс, остальные садятся легко (кооперативность).

Эффект Бора: лёгкие ⇄ ткань

Где Hb берёт кислород, а где отдаёт? В лёгких — набирает, в кислой работающей ткани — отдаёт больше. Переключай.

В тканях: кислоты и CO₂ много (эффект Бора) — Hb переходит в T-форму и отдаёт больше O₂ именно там, где идёт работа.

Викторина: гемоглобин

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Почему кривая насыщения гемоглобина S-образная, а не гиперболическая?

Счёт: 0 / 0
подраздел 1·VI

🧩 Многообразие белков

3 модели

Глобулярный ⇄ фибриллярный

Два главных типа формы. Клубок — растворимый и работящий; нить — прочная и опорная. Переключай и сравнивай.

Глобулярный: компактный клубок, растворим в воде (гидрофобное ядро спрятано внутрь), подвижная форма с карманами для активного центра. Работает: ферменты, гемоглобин, антитела.

Сложные белки: довесок → класс

У сложного белка есть небелковый «довесок» (простетическая группа), который часто и определяет функцию. Выбери довесок — увидишь класс белка и роль.

Довесок

Гем → класс Гемопротеины. Роль довеска: переносить O₂ (гемоглобин, миоглобин) и электроны (цитохромы).

Викторина: многообразие белков

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Чем сложный белок отличается от простого?

Счёт: 0 / 0
подраздел 1·VII

⚗️ Свойства и методы выделения

4 модели

Электрофорез белков сыворотки

Белки крови делятся на фракции (альбумин, α1, α2, β, γ). Форма кривой — диагностический «штрихкод». Выбери картину и прочти, о чём она говорит.

Картина

Норма. Крупный пик альбумина, умеренные глобулины — здоровая протеинограмма.

Метод разделения → по какому свойству

Каждый метод сортирует белки по одному их свойству. Выбери метод — увидишь, что именно он разделяет и как.

Метод

Гель-фильтрация (эксклюзионная) — разделяет по размеру молекул. Как это работает: мелкие застревают в порах гранул и идут медленнее; крупные выходят первыми.

Растворимость белка от pH (изоэлектрическая точка)

Растворимость минимальна в изоэлектрической точке (pI): заряд нулевой, молекулы слипаются. Двигай pH.

pH
7.0

pH 7.0 → растворимость ≈ 48%. Вдали от pI белок заряжен, молекулы отталкиваются и лучше растворимы.

Викторина: свойства и методы

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

При какой pH растворимость белка минимальна?

Счёт: 0 / 0
подраздел 1·VIII

🔄 Изменения белкового состава

4 модели

Азотистый баланс

Сравнение азота, поступившего с белком, и выведенного. Плюс — рост и выздоровление; минус — голод и болезнь; ноль — здоровый взрослый. Выбери ситуацию.

Ситуация

Здоровый взрослый. Приход азота равен расходу — баланс НУЛЕВОЙ (равновесие).

Гликирование: сахар → HbA1c

Глюкоза сама «прилипает» к белкам. Чем выше средний сахар, тем больше HbA1c и вредных AGE. Двигай средний сахар.

Средний сахар, ммоль/л
6.0

Средний сахар 6.0 ммоль/л → HbA1c ≈ 5.4%. Норма.

Энзимодиагностика: орган → маркёр

При повреждении органа его ферменты «вытекают» в кровь. Выбери состояние — увидишь, какие ферменты растут.

Состояние

Инфаркт миокарда → в крови растут: Тропонины, КК-МВ (из органа: сердце).

Викторина: изменения белкового состава

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Азотистый баланс отрицательный — это когда…

Счёт: 0 / 0
02

Энзимология

28 моделей
подраздел 2·I

🧪 Ферменты как катализаторы

4 модели

Энергия активации: с ферментом и без

Реакции мешает «горка» — энергия активации Eа. Фермент делает её ниже, поэтому реакция идёт быстрее. Уровни субстрата и продукта не меняются — равновесие фермент не сдвигает. Нажми кнопку.

Без фермента: высокий барьер Eа — мало молекул его преодолевают, реакция медленная. Нажми кнопку — добавим фермент.

Ферментативный цикл: E + S ⇄ ES → E + P

Фермент связывает субстрат в активном центре (ES), превращает его и отпускает продукт, оставаясь свободным. Жми «Дальше».

E + S: фермент и субстрат по отдельности

Специфичность: подходит ли субстрат?

Активный центр узнаёт «свой» субстрат, как замок ключ. Уреаза принимает только мочевину. Выбери вещество — подойдёт или нет?

Вещество

Мочевина: Подходит! Уреаза узнаёт именно мочевину — реакция идёт (NH₃ + CO₂).

Викторина: ферменты как катализаторы

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Как фермент ускоряет реакцию?

Счёт: 0 / 0
подраздел 2·II

🗂️ Классы и номенклатура ферментов

3 модели

Семь классов ферментов

Ферменты делят по типу реакции. Выбери класс — увидишь, что он делает, и пример реакции.

Класс

1. Оксидоредуктазы — окисление-восстановление (перенос водорода/электронов). Пример: Лактат ⇄ Пируват (лактатдегидрогеназа, +НАД⁺).

Определи класс реакции

Дана реакция — выбери, к какому классу относится фермент. Правильный ответ подсветится.

Лактат ⇄ Пируват (+НАД⁺ → НАДН)

Счёт: 0 / 0

Викторина: классы и номенклатура

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Сколько классов ферментов в современной классификации?

Счёт: 0 / 0
подраздел 2·III

🔑 Кофакторы и коферменты

3 модели

Апофермент + кофактор = холофермент

Белковая часть без помощника (апофермент) не работает. Добавь кофактор — получится холофермент, и реакция пойдёт. Нажми кнопку.

Апофермент: только белковая часть, без кофактора — фермент НЕ работает. Нажми кнопку и добавь кофактор.

Кофермент → витамин → что переносит

Почти каждый кофермент сделан из витамина группы B и переносит что-то своё. Выбери кофермент — увидишь его витамин и «груз».

Кофермент

НАД⁺ / НАДФ⁺ — из витамина B3 (ниацин, PP). Переносит: водород и электроны. Пример фермента: дегидрогеназы (ЛДГ, ПДГ).

Викторина: кофакторы и коферменты

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Апофермент — это…

Счёт: 0 / 0
подраздел 2·IV

⚙️ Механизм действия ферментов

3 модели

Приёмы катализа

Фермент ускоряет реакцию не одним, а несколькими способами. Выбери приём — увидишь, как он работает.

Приём

Стабилизация переходного состояния: активный центр комплементарен именно переходному состоянию — связывает его крепче всего и снижает барьер (главный приём).

Каталитическая триада Ser–His–Asp (химотрипсин)

Как сериновая протеаза режет белок: гистидин активирует серин, серин атакует связь, аспартат помогает. Жми «Дальше» и следи за шагами.

Субстрат (пептид) вошёл в активный центр. Триада Ser-His-Asp наготове.

Викторина: механизм действия

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Главный приём ферментативного катализа — это…

Счёт: 0 / 0
подраздел 2·V

📉 Кинетика ферментов

3 модели

Кривая Михаэлиса–Ментен и график Лайнуивера–Бэрка

Скорость v = Vmax·[S] / (Km + [S]). Двигай Vmax и Km. Кнопкой переключай на «перевёрнутый» график (1/v против 1/[S]) — там прямая линия.

Vmax
80
Km
16

Кривая Михаэлиса–Ментен: Vmax = 80, Km = 16. При [S] = Km скорость = ½Vmax. Маленький Km — высокое сродство (насыщение при низком [S]).

Кооперативность: гипербола ⇄ сигмоида

У обычного фермента кривая — дуга (n=1). У кооперативного (аллостерического) — S-образная. Двигай коэффициент Хилла n и сравни с пунктирной гиперболой.

Коэффициент Хилла n
1.0

n ≈ 1: обычный фермент — гиперболическая кривая (Михаэлис–Ментен), нет кооперативности.

Викторина: кинетика ферментов

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Vmax — это…

Счёт: 0 / 0
подраздел 2·VI

🚫 Ингибирование ферментов

3 модели

Кинетика с ингибитором

Как ингибитор меняет кривую Михаэлиса–Ментен. Выбери тип и подвигай силу ингибитора [I] — смотри, что происходит с Vmax и Km (серая пунктирная — без ингибитора).

Тип
Сила [I]
20
Vmax
80
Km
16

Кажущиеся: Vmax = 80, Km = 48.0. Конкурентное: ↑Km, Vmax неизменна (преодолевается избытком субстрата).

Куда садится ингибитор?

Разные ингибиторы связываются в разных местах. Выбери тип — увидишь, куда садится и что это даёт.

Тип

Конкурентное: ингибитор садится в активный центр (вместо субстрата). Эффект: ↑Km, Vmax не меняется — преодолевается избытком субстрата.

Викторина: ингибирование

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Конкурентный ингибитор изменяет кинетику так:

Счёт: 0 / 0
подраздел 2·VII

🎛️ Регуляция обмена

3 модели

Механизмы регуляции ферментов

Активность фермента можно менять по-разному — быстро и медленно. Выбери механизм — увидишь, как он работает и как быстро.

Механизм

Аллостерическая регуляция (быстрая, секунды): эффектор-метаболит садится в регуляторный центр и меняет активность; конечный продукт тормозит первый фермент (ретроингибирование).

Ретроингибирование пути (обратная связь)

Путь A→B→C→D. Когда конечного продукта D много, он тормозит первый фермент — весь путь замедляется. Двигай уровень продукта D.

Уровень продукта D
20

Конечного продукта D: 20% → фермент 1 заторможен на ~18% → поток по пути ≈ 82%. Много продукта = «стоп» на старте пути (экономия ресурсов).

Викторина: регуляция обмена

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Самый быстрый способ регуляции фермента — это…

Счёт: 0 / 0
подраздел 2·VIII

🧬 Энзимопатии

3 модели

Метаболический блок

Путь A→B→C. Сломай фермент 2 — увидишь, как перед ним копится B (и уходит в необычное вещество X), а продукта C не хватает. Из этого и складывается болезнь.

Всё работает: A→B→C идёт нормально, ничего не копится. Нажми кнопку — «сломаем» фермент 2.

Каталог энзимопатий

Выбери болезнь — увидишь цепочку: какой фермент сломан → что копится → симптомы → лечение.

Болезнь

Фенилкетонурия (ФКУ). Сломан фермент: фенилаланингидроксилаза. Копится: фенилаланин. Симптомы: поражение мозга без лечения. Лечение: диета без фенилаланина.

Викторина: энзимопатии

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Что происходит в пути при выпадении фермента (метаболический блок)?

Счёт: 0 / 0
подраздел 2·IX

💊 Ферменты в медицине

3 модели

Как ферменты применяют в медицине

Ферменты — и диагностика, и лекарства, и точные реактивы. Выбери направление — увидишь суть и примеры.

Направление

Диагностика (энзимодиагностика): по активности вытекших ферментов узнают поражённый орган. Примеры: АЛТ/АСТ (печень), тропонин и КК-МВ (сердце), амилаза/липаза (панкреатит).

Динамика ферментов-маркёров инфаркта

После инфаркта разные ферменты поднимаются и спадают в своё время. Выбери маркёр — он подсветится, и увидишь, когда он «работает».

Маркёр

Тропонин: главный маркёр: держится 7-10 дней, самый специфичный для сердца.

Викторина: ферменты в медицине

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Энзимодиагностика основана на том, что…

Счёт: 0 / 0
03

Витамины

3 модели
подраздел 3·I

🍊 Витамины

3 модели

Каталог витаминов

Выбери витамин — увидишь цепочку: его форма/кофермент → функция → болезнь дефицита. Зелёные — водорастворимые, оранжевые — жирорастворимые.

Витамин

B1 (тиамин) (водорастворимый). Форма/кофермент: ТДФ. Функция: декарбоксилирование кетокислот. Дефицит: бери-бери, Вернике.

Игра: болезнь дефицита → какой витамин?

Дан симптом/болезнь недостаточности — выбери, какого витамина не хватает. Правильный ответ подсветится.

Пеллагра: дерматит, диарея, деменция

Счёт: 0 / 0

Викторина: витамины

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Жирорастворимые витамины — это…

Счёт: 0 / 0
04

Биосинтез нуклеиновых кислот и белков. Основы молекулярной генетики

27 моделей
подраздел 4·I

🧬 Нуклеиновые кислоты

3 модели

Комплементарные пары оснований

Основания спариваются строго: A с T (или U), G с C. Выбери основание — увидишь его пару и число водородных связей.

Основание

Аденин (A) (пурин (2 кольца), ДНК и РНК). Пара: T (в ДНК) или U (в РНК), удерживается 2 водородными связями.

Собери комплементарную цепь ДНК

Дана одна цепь ДНК. Дострой вторую по правилу A↔T, G↔C (цепи антипараллельны), затем нажми «Показать» для проверки.

Дана верхняя цепь 5'-ATGCGTA-3'. Дострой вторую по правилу A↔T, G↔C, потом нажми «Показать».

Викторина: строение ДНК и РНК

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

С каким основанием спаривается аденин в ДНК?

Счёт: 0 / 0
подраздел 4·II

🔁 Репликация ДНК

3 модели

Полуконсервативная репликация

Родительская спираль расходится, и на каждой старой цепи достраивается новая. В каждой дочерней ДНК — одна старая цепь и одна новая. Жми «Дальше».

Полуконсервативная репликация. Родительская ДНК: обе цепи старые (синие).

Репликативная вилка: ведущая и отстающая цепь

Полимераза строит только 5'→3'. Поэтому одна цепь растёт непрерывно (ведущая), а другая — короткими фрагментами (отстающая). Выбери цепь.

Цепь

Ведущая цепь: синтезируется непрерывно, по ходу движения вилки (в направлении 5'→3', совпадает с расплетанием).

Викторина: репликация

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Репликация ДНК называется полуконсервативной, потому что…

Счёт: 0 / 0
подраздел 4·III

🛠️ Репарация ДНК

3 модели

Эксцизионная репарация: вырезать → заполнить → сшить

Повреждённый участок вырезают, а брешь достраивают по целой цепи и сшивают. Жми «Дальше» и следи за шагами.

Эксцизионная репарация. В ДНК есть повреждение (красное). Вторая цепь цела.

Повреждение → способ репарации

Каждому типу повреждения соответствует свой механизм починки. Выбери повреждение — увидишь, кто и как его чинит.

Повреждение

Тиминовый димер (УФ)Эксцизионная репарация нуклеотидов (NER): вырезают целый участок цепи (~25-30 нуклеотидов) вместе с димером.

Викторина: репарация

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Тиминовые димеры от УФ у человека исправляет…

Счёт: 0 / 0
подраздел 4·IV

✍️ Транскрипция

3 модели

Стадии транскрипции

РНК-полимераза садится на промотор (инициация), едет по гену и наращивает РНК (элонгация), на сигнале конца останавливается (терминация). Жми «Дальше».

Транскрипция. Инициация: РНК-полимераза села на промотор, расплела ДНК и начала синтез.

Созревание мРНК (кэп, сплайсинг, полиА)

У эукариот черновик мРНК дорабатывают: ставят кэп и полиА-хвост, вырезают интроны и сшивают экзоны. Жми «Дальше».

Созревание мРНК. Первичный транскрипт (пре-мРНК): экзоны (зелёные, полезные) чередуются с интронами (серыми, лишними).

Викторина: транскрипция

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Транскрипция — это синтез…

Счёт: 0 / 0
подраздел 4·V

🏭 Трансляция (синтез белка)

3 модели

Генетический код: расшифруй кодон

Собери кодон из трёх букв мРНК — увидишь, какую аминокислоту он кодирует (или стоп-сигнал). Обрати внимание на вырожденность: разные кодоны → одна аминокислота.

1-я
2-я
3-я

Кодон UUU кодирует аминокислоту фенилаланин. Одну аминокислоту часто кодируют несколько кодонов (вырожденность).

Цикл работы рибосомы (сайты A, P, E)

Как рибосома удлиняет цепь: новая тРНК входит в сайт A, образуется пептидная связь, рибосома сдвигается (тРНК идут A→P→E). Жми «Дальше».

Цикл элонгации. В сайте P — тРНК с растущей пептидной цепью; сайт A свободен, напротив него — следующий кодон.

Викторина: трансляция

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Трансляция — это синтез…

Счёт: 0 / 0
подраздел 4·VI

🎯 Ингибиторы матричного синтеза

3 модели

Где бьёт лекарство? (поток ДНК → РНК → белок)

Каждый ингибитор блокирует свой этап. Выбери препарат — увидишь, какой шаг он перекрывает (красный крестик) и против кого направлен.

Препарат

Ципрофлоксацин блокирует репликация ДНК (блокирует бактериальную ДНК-гиразу). Мишень: бактерии.

Избирательная токсичность: почему щадит человека?

Хорошее лекарство бьёт по «чужому» сильнее, чем по нам. Выбери группу — увидишь, за счёт чего достигается избирательность.

Группа

Антибиотики (против бактерий): у бактерий свои ферменты и рибосома 70S — лекарство бьёт по ним, щадя человека (рибосома 80S).

Викторина: ингибиторы матричного синтеза

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Фторхинолоны (ципрофлоксацин) блокируют…

Счёт: 0 / 0
подраздел 4·VII

🎚️ Регуляция генов

3 модели

Lac-оперон: индукция (бактерии)

Нет лактозы — репрессор держит гены выключенными. Появилась лактоза — она снимает репрессор, и гены её усвоения включаются. Нажми кнопку.

Лактозы нет → ген ВЫКЛючен. Белок-репрессор сидит на операторе и не пускает полимеразу — незачем делать ферменты для отсутствующей лактозы.

Эпигенетика: метка выключает или включает ген

Метилирование ДНК глушит ген (плотный хроматин), ацетилирование гистонов его включает (раскрытый хроматин). Переключай.

Состояние

Метилирование ДНК: метки на цитозине в промоторе + плотная упаковка хроматина — ген недоступен, молчит. Метка наследуется дочерними клетками.

Викторина: регуляция генов

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Оперон — это…

Счёт: 0 / 0
подраздел 4·VIII

🧬 Изменчивость и болезни

3 модели

Точечная мутация: замени букву в кодоне

Норма — кодон GAG (глутамат) в 6-м положении β-глобина. Поменяй нуклеотиды и смотри тип мутации: молчащая, миссенс или нонсенс. Поставь G-U-G — получишь серповидноклеточную анемию (Glu→Val).

1
2
3

Замены нет: кодон прежний, аминокислота глутамат.

Наследование: решётка Пеннета

Выбери тип наследования и посмотри, каким будет потомство и с каким риском болезни. Цвет клетки: зелёный — здоров, жёлтый — носитель, красный — болен.

Тип наследования

Аутосомно-рецессивное. 25% больны (aa), 50% носители (Aa), 25% здоровы (AA).

Викторина: изменчивость и наследственные болезни

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Серповидноклеточная анемия — это мутация…

Счёт: 0 / 0
подраздел 4·IX

🧪 ДНК-технологии в медицине

3 модели

ПЦР: размножение ДНК по циклам

Полимеразная цепная реакция — «ксерокс» для ДНК. Каждый цикл (нагрели → остудили → достроили) удваивает число копий. Жми «+1 цикл» и смотри, как из одной молекулы вырастают миллиарды.

После 0 циклов из одной молекулы — 1 копий: каждый цикл удваивает (2^0). За ~30 циклов получают больше миллиарда копий — этого хватает для анализа.

Гель-электрофорез: диагностика по полосам (ПДРФ)

ДНК режут рестриктазой и разгоняют в геле: фрагменты расходятся по размеру (мелкие бегут дальше). Если мутация убрала сайт разреза — картина полос меняется. Сравни норму и мутацию с маркёром размеров.

Образец

Норма: сайт для рестриктазы на месте — ДНК разрезана на два фрагмента (2000 и 1000 bp) → две полосы. Мелкие фрагменты бегут в геле дальше.

Викторина: ДНК-технологии

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

ПЦР нужна, чтобы…

Счёт: 0 / 0
05

Биологические мембраны

15 моделей
подраздел 5·I

🧈 Мембрана: строение и текучесть

3 модели

Жидкостно-мозаичная модель: текучесть мембраны

Мембрана — двойной слой липидов (голубые головы + жёлтые хвосты) с плавающими белками. Двигай температуру и включай/выключай холестерин — смотри, как меняется текучесть (упаковка хвостов).

Температура
40%
Холестерин

Температура 40%, холестерин: есть. Состояние мембраны: нормальная текучесть. Выше температура — липиды подвижнее (мембрана текучее). Холестерин сглаживает изменения: не даёт ни застыть, ни слишком растечься.

Разнообразие мембран: состав под функцию

У каждой мембраны свой состав (соотношение белок/липид) под её работу. Выбери мембрану — сравни, сколько в ней белков и зачем.

Мембрана

Плазматическая мембрана (~50/50 белка). много холестерина и гликолипидов; барьер, рецепторы, узнавание клеток (гликокаликс снаружи). Вывод: состав мембраны подстроен под её функцию.

Викторина: строение и роль мембран

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Основа биологической мембраны — это…

Счёт: 0 / 0
подраздел 5·II

🧱 Белки мембран

3 модели

Типы белков по расположению в мембране

Белки сидят в мембране по-разному. Выбери тип — увидишь, где именно располагается белок и чем удерживается.

Тип белка

Интегральный (трансмембранный) — пронизывает бислой насквозь; трансмембранный участок — α-спираль из гидрофобных аминокислот. Удаляется только детергентом.

Функции мембранных белков

Мембранные белки — исполнители функций мембраны. Выбери функцию — увидишь, что делает белок и примеры.

Функция

Транспорт: каналы, переносчики и насосы проводят ионы и вещества через бислой (Na⁺/K⁺-АТФаза, GLUT).

Викторина: белки мембран

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Интегральные мембранные белки…

Счёт: 0 / 0
подраздел 5·III

🚪 Перенос через мембрану

3 модели

Виды транспорта: по градиенту или против

Выбери способ переноса — увидишь, куда идёт вещество (по градиенту/против) и нужна ли энергия. Стрелка показывает направление, белок — переносчик или насос.

Способ

Простая диффузия — по градиенту, без энергии. мелкая неполярная молекула (O₂, CO₂) сама проходит через липид из «где много» в «где мало». Белок не нужен.

Na⁺/K⁺-АТФаза: цикл насоса по шагам

Главный насос клетки за 1 АТФ выкачивает 3 Na⁺ и закачивает 2 K⁺. Жми «следующий шаг» и проследи цикл.

Шаг 1/4. 3 иона Na⁺ садятся в насос со стороны цитозоля, связывается АТФ.

Викторина: транспорт через мембрану

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Пассивный транспорт идёт…

Счёт: 0 / 0
подраздел 5·IV

🤝 Межклеточные взаимодействия

3 модели

Типы межклеточных контактов

Клетки соединяются по-разному. Выбери тип контакта между двумя клетками — увидишь его устройство и назначение.

Контакт

Плотный контакт — белки соседних клеток (клаудины, окклюдины) смыкаются в шов — вещества не проходят между клетками, только сквозь них. Барьер и полярность.

Молекулы клеточной адгезии (CAM)

Разные «липучки» связывают разное. Выбери семейство — увидишь, что оно узнаёт и зачем.

Семейство

Кадгерины связывают: такой же кадгерин на соседней клетке (гомофильно), нужен Ca²⁺. Роль: скрепляют однотипные клетки; основа адгезионных контактов и десмосом.

Викторина: межклеточные взаимодействия

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Плотные контакты (tight junctions)…

Счёт: 0 / 0
подраздел 5·V

📡 Передача сигнала

3 модели

Классы мембранных рецепторов

Разные рецепторы принимают сигнал по-разному. Выбери класс — увидишь его устройство и путь сигнала.

Рецептор

GPCR (сопряжён с G-белком) — 7 раз пронизывает мембрану. Лиганд снаружи → активирует G-белок → вторичные посредники (цАМФ, ИФ₃). Пример: адренорецептор.

Каскад сигнала и усиление (адреналин → цАМФ)

Проследи путь сигнала по шагам: адреналин → рецептор → G-белок → аденилатциклаза → цАМФ → ПКА → ответ. Смотри, как на каждом шаге сигнал усиливается.

Шаг 1/6. Одна молекула адреналина садится на рецептор (GPCR) снаружи клетки. Усиление ≈ ×1.

Викторина: передача сигнала

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Гидрофильный сигнал (адреналин) действует через…

Счёт: 0 / 0
06

Энергетический обмен

12 моделей
подраздел 6·I

🔥 Биологическое окисление

3 модели

Дегидрирование: отнятие водорода

Главный способ окисления — отнять у вещества водород. Нажми кнопку: дегидрогеназа заберёт 2 атома H и «зарядит» кофермент НАД⁺ → НАДН.

Исходное состояние. Субстрат несёт 2 атома водорода, НАД⁺ пуст. Нажми кнопку — дегидрогеназа отнимет водород и «зарядит» кофермент.

Коферменты-переносчики окисления

Разные переносчики несут разное (водород или электроны) и работают на разных участках. Выбери переносчик — увидишь, что и куда он тащит.

Переносчик

НАД⁺ несёт гидрид (2e⁻ + H⁺) (растворим в воде). Работает: дегидрогеназы → комплекс I ЦПЭ.

Викторина: биологическое окисление

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Главный способ биологического окисления в клетке —

Счёт: 0 / 0
подраздел 6·II

⚡ Окислительное фосфорилирование

3 модели

Хемиосмос: от электронов к АТФ

Проследи по шагам, как энергия электронов превращается в АТФ: цепь качает протоны в «плотину», а АТФ-синтаза-турбина делает АТФ на их обратном потоке.

Шаг 1/4. НАДН приносит электроны и отдаёт их комплексу I дыхательной цепи (ФАДН₂ входит через комплекс II).

Что ломает окислительное фосфорилирование

Сравни норму, разобщитель и два вида ингибиторов. Смотри на полоски: потребление кислорода, градиент, АТФ и тепло.

Режим

Норма (сопряжено). электроны текут, протоны качаются, градиент высокий, АТФ-синтаза делает много АТФ. Тепла немного.

Викторина: окислительное фосфорилирование

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Окислительное фосфорилирование синтезирует АТФ за счёт…

Счёт: 0 / 0
подраздел 6·III

🔄 Цикл Кребса и доноры водорода

3 модели

Окисление пирувата → ацетил-КоА

Пируват из глюкозы окисляется в ацетил-КоА: теряется CO₂, снимается водород на НАДН. Нажми кнопку и посмотри реакцию ПВК-дегидрогеназы.

Исходно: пируват (3 углерода) готов войти в митохондрию. Нажми кнопку — комплекс окислит его в ацетил-КоА.

Колесо цикла Кребса: где снимается водород

Пройди цикл по шагам. Смотри, на каких стадиях образуются НАДН, ФАДН₂, ГТФ и CO₂, и как копится итог одного оборота (3 НАДН, 1 ФАДН₂, 1 ГТФ, 2 CO₂).

Цитрат. Накоплено за оборот: 0 НАДН, 0 ФАДН₂, 0 ГТФ, 0 CO₂.

Викторина: общий этап катаболизма

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Общий заключительный этап катаболизма — это…

Счёт: 0 / 0
подраздел 6·IV

🧯 Токсичные формы кислорода

3 модели

Каскад АФК: от искры до воды

Проследи, как из кислорода получаются активные формы (супероксид → перекись) и что дальше: с железом — опасный гидроксил-радикал, а с ферментами — безопасная вода.

Шаг 1/4. Часть электронов цепи «утекает» прямо на кислород — он восстанавливается лишь одним электроном, образуется супероксид, первая активная форма кислорода.

Антиоксидантная защита

Клетку защищают ферменты и витамины. Выбери защитника — увидишь, что он делает и на каком этапе обрывает АФК.

Защитник

Супероксиддисмутаза (СОД): убирает супероксид (первую АФК), превращая его в перекись водорода. (2 O₂•⁻ + 2H⁺ → H₂O₂ + O₂)

Викторина: активные формы кислорода

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Активные формы кислорода (АФК) образуются, когда кислород…

Счёт: 0 / 0
07

Обмен углеводов

15 моделей
подраздел 7·I

🍬 Строение углеводов

3 модели

Уровни организации: моно-, ди-, полисахариды

Углеводы бывают простыми и сложными. Выбери уровень — увидишь, из скольких звеньев состоит сахар и какие бывают примеры.

Уровень

Моносахарид — простой сахар, не расщепляется гидролизом. Одно звено. Примеры: глюкоза, фруктоза, рибоза.

Формы моносахарида: альдоза, кетоза, кольцо, аномеры

Один сахар может выглядеть по-разному. Выбери форму — увидишь, где карбонил и как образуется кольцо с α/β-аномерами.

Форма

Альдоза. карбонильная группа — альдегидная (на конце цепи). Пример: глюкоза.

Викторина: строение углеводов

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Углеводы — это…

Счёт: 0 / 0
подраздел 7·II

🍽️ Переваривание углеводов

3 модели

Путь углеводов по ЖКТ

Пройди по этапам: где какой фермент работает и что получается. От рта до щёточной каймы кишечника.

Рот. Фермент: α-амилаза слюны (птиалин). начинает расщеплять крахмал (α-1,4) → декстрины и немного мальтозы. Действует недолго.

Дисахаридазы: кто что режет

На стенке кишки каждый дисахарид расщепляет свой фермент. Выбери фермент — увидишь субстрат и продукты.

Фермент

Мальтаза расщепляет α-1,4-связь → глюкоза + глюкоза. Происходит на щёточной кайме, продукты сразу всасываются.

Викторина: переваривание углеводов

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Всасываться в кровь способны…

Счёт: 0 / 0
подраздел 7·III

🚪 Транспорт глюкозы

3 модели

Переносчики глюкозы: GLUT и SGLT

У глюкозы много переносчиков. Выбери — увидишь, где он работает, по градиенту или против, и зависит ли от инсулина.

Переносчик

GLUT1 (облегчённая диффузия, по градиенту). Ткань: эритроциты, мозг (ГЭБ). постоянный базовый захват глюкозы; не зависит от инсулина.

Всасывание глюкозы через энтероцит

Клетка кишки переносит глюкозу из просвета в кровь. Пройди шаги: SGLT1 втягивает → накопление → GLUT2 выпускает → насос держит градиент.

Шаг 1/4. Со стороны просвета кишки SGLT1 тянет глюкозу внутрь против градиента, используя вход Na⁺.

Викторина: транспорт глюкозы

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

GLUT-переносчики переносят глюкозу…

Счёт: 0 / 0
подраздел 7·IV

🤧 Нарушения переваривания углеводов

3 модели

Механизм: что делает непереваренный сахар

Пройди по шагам, почему возникают понос и вздутие: сахар остаётся → тянет воду → бактерии сбраживают → газы и кислоты.

Шаг 1/4. Из-за дефицита фермента или переносчика углевод не превращается в моносахарид или не всасывается — он остаётся в просвете кишки.

Виды нарушений переваривания/всасывания

Разные дефекты — разная непереносимая пища. Выбери нарушение — увидишь причину, что не переносится и что накапливается.

Нарушение

Дефицит лактазы. Причина: нет фермента лактазы (щёточная кайма). Не переносится: молоко (лактоза). самая частая непереносимость; дозозависимая.

Викторина: нарушения переваривания углеводов

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Непереваренный/невсосавшийся сахар в кишке вызывает…

Счёт: 0 / 0
подраздел 7·V

🔀 Метаболизм глюкозы

3 модели

Судьбы глюкозо-6-фосфата (перекрёсток)

G6P — узел обмена глюкозы. Выбери путь — увидишь, куда пойдёт глюкоза и зачем: энергия, запас, синтезы или обратно в глюкозу.

Путь

Гликолиз: → пируват + 2 АТФ + 2 НАДН. Зачем: получение энергии. Это один из путей от глюкозо-6-фосфата.

Гексокиназа vs глюкокиназа

Оба фермента фосфорилируют глюкозу, но по-разному. Выбери фермент — сравни кривые: гексокиназа насыщается рано (жадная), глюкокиназа — поздно (сенсор).

Фермент

Гексокиназа (большинство тканей): высокое сродство (низкий Km), тормозится продуктом (G6P). базовое снабжение: работает даже при низкой глюкозе.

Викторина: метаболизм глюкозы

Проверь себя. Четыре варианта — сразу видно правильный.

Сразу после входа в клетку глюкоза…

Счёт: 0 / 0
Справочник

Все фигуры курса

43 фигуры
titrationТитрование: заряд и pI
electrophoresisЭлектрофорез по заряду
hydropathyШкала гидрофобности
peptideКонструктор пептида
saturationНасыщение лиганда и Kd
cooperativityКооперативность (Хилл)
michaelis-mentenКинетика Михаэлиса–Ментен
enzyme-inhibitionИнгибирование фермента
inhibitor-kineticsКинетика с ингибитором
hemoglobin-saturationНасыщение гемоглобина кислородом
hemoglobin-stateГемоглобин: T ⇄ R
protein-solubilityРастворимость белка от pH
activation-energyЭнергия активации
glycationГликирование: сахар → HbA1c
dna-strandКомплементарная цепь ДНК
membrane-fluidityТекучесть мембраны
chiralityХиральность: L и D
cis-transПептидная связь: цис/транс
condensationКонденсация ↔ гидролиз
disulfideДисульфидный мостик
levelsУровни структуры белка
sec-structα-спираль и β-слой
shapeГлобула ⇄ фибрилла
protein-shapeГлобулярный и фибриллярный
denatДенатурация
forcesСилы третичной структуры
funnelВоронка сворачивания
chaperoninШаперонин: камера
qcКонтроль качества белка
fitИндуцированное соответствие
motorМолекулярный мотор
ramaДиаграмма Рамачандрана
feedback-inhibitionРетроингибирование
metabolic-blockМетаболический блок
holoenzymeАпофермент + кофактор
dehydrogenationДегидрирование
pyruvate-oxidationОкисление пирувата
bohr-effectЭффект Бора: лёгкие ⇄ ткань
epigeneticsЭпигенетика: метка гена
operonLac-оперон
replication-forkРепликативная вилка
pcrПЦР по циклам
gel-electrophoresisГель-электрофорез (ПДРФ)